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DNA親子鑒定主要通過以下特征來判定
體細胞穩定性：同一個體的血液、口腔細胞、精液以及各器官組織DNA是一致的，并且對同一健康人來說是終生不變的，這是最基本的前提。
個體高度特異性：不同個體DNA 分子水平上遺傳本質的差異，決定了同一種限制酶消化基因組DNA ，某一個體與另一個體的等位基因片段在數量和長度上是不可能相同的，從而產生具有個體特異性的DNA 。
按孟德爾遺傳規律遺傳：通過大量的家系調查證明，子代DNA 中所有等位基因帶都可以在雙親的DNA中找到，片段的傳遞符合孟德爾遺傳規律。